Vo vojne sa nepriateľ snaží predovšetkým zničiť vojenské objekty: letiská, vojenské jednotky, muničné sklady. V Atomic Fighter 2D prevezmete kontrolu nad stíhačkou na ochranu neba nad vojenskou základňou. Už sa k nej blíži letka nepriateľských útočných lietadiel a bombardérov. Vašou úlohou je držať obranu a aktívne útočiť na nepriateľa pozdĺž celého frontu. Presuňte stíhačku doľava alebo doprava, vzdiaľte sa od ostreľovania smerom k lietajúcim nepriateľským lietadlám a útočte a strieľajte na seba a ničte lietadlá jedno po druhom. Za behu zbierajte rôzne bonusy, ktoré vám pomôžu vyrovnať sa s obrovským množstvom postupujúcich nepriateľov v Atomic Fighter 2D.
