Agent Smith v Matrixe je modul agenta, počítačový program, ktorý prenasledoval hlavného hrdinu Nea. Smith sa môže prepísať na iných agentov, čím vytvorí veľa svojich kópií. V hre Mr Smith bude musieť hrdina bojovať s celou armádou Smithov a nemôže sa zaobísť bez vašej pomoci. Je nevyhnutné zničiť nepriateľov, pretože Smith považuje ľudí za vírus, čo znamená, že od neho neočakávate milosrdenstvo. Na každej úrovni musíte nepriateľa zničiť presnými výstrelmi. Ak nie je v streľbe, použite ricochet. Pamätajte, že náboje hrdinu sú obmedzené. Ich počet sa zobrazuje v ľavom hornom rohu. Veľa šťastia.