Vírusy vyhlásili vojnu proti ľudskosti a stále víťazia, ale ľudia sa nevzdávajú pokusov o rýchle nájdenie vakcíny. V hre sa medzitým vyvinula život zachraňujúca vakcína, nielen jeden, ale na rôzne typy vírusov, ktoré sa množia rýchlosťou zvuku. V hre Kill The Virus sa stanete skutočným zabijakom vírusov. Povstanú pred vami ešte hroznejšie ako iné. Vyhoďte ich naplnené injekčnými striekačkami, snažte sa byť pozorný a presný. Do už prilepenej injekčnej striekačky sa nemôžete dostať, inak vírusové monštrum prežije a skleslo. Ak chcete prejsť úrovňou, musíte zastreliť všetky pripravené vakcíny.