Keď sa pekné brány už podarilo uzamknúť, zlí duchovia neopustili nádej, že znova uvoľnia cestu a po mnohých rokoch sa im podarilo. Tentoraz otvorili portál na Marse v nádeji, že ľudia ho nemôžu ihneď nájsť. Ale Mars bol už kolonizovaný, na ňom sa usadili mnohé biologické laboratóriá a množstvo vedcov pracovalo, všetci boli vystavení krutému útoku príšer. Tvoj tím na zametanie musí zničiť monštrá v Doom 3 a nemusíš mať skúsenosti. Choďte na červenú planétu a buďte opatrní, príšery sa stali múdrejšími a silnejšími.
