Daleko vo vesmíre, na obežnej dráhe jednej z planét, bola kozmická loď, na ktorej bolo laboratórium, v ktorom boli experimenty vykonávané na rôznych zvieratách. Boli im vstreknuté cudzie DNA a sledovali sa, keď sa zmenili. Rovnako ako so základňou, spojenie zmizlo a vojaci boli tam poslaní z hviezdy Assault. Budeme jedným z nich v hre Attack on the Mothership. Naša postava je vyzbrojená štandardnou muníciou. Jeho úlohou je preniknúť na loď a zistiť, čo sa tam stalo. Ako sa ukázalo, celá posádka sa stala monštrami a teraz musíte s nimi bojovať. Pomocou zbraní musíte rýchlo a účinne zničiť všetky príšery, s ktorými sa stretnete na palube lode.
