Hrdina hry Escape the Giant School 3D sa zrazu stal veľmi malým a ocitol sa v škole, ktorá sa pre neho stala gigantickou. Obyčajné knihy, ceruzky a guma sa zmenili na prekážky v chlapcovej ceste a on chce rýchlo opustiť školu, ktorá sa stala nebezpečnou. Pomôžte mu prekonať prekážky v podobe obrovských písacích potrieb, učebníc a iných predmetov, ktoré študent bežne používa. Preskočte cez gumy a ceruzky, cez knihy a stoly, dostaňte sa do cieľa a presuňte sa na nové miesto v hre Escape the Giant School 3D.