Square v Catching the Flag sa chce dostať von z podzemných katakomb, ale na to potrebuje dosiahnuť vlajku v každej úrovni. Celkovo ich je desať a musíte hrdinovi pomôcť prekonať prekážky. Štvorec môže skákať a kĺzať, to vám pomôže bezpečne sa vyhnúť hrotom a dieram. Okrem toho na každej ďalšej úrovni pribudnú ďalšie prekážky, vrátane červených guličiek a iných predmetov, ktoré sa neustále pohybujú rôznymi smermi. Úrovne obtiažnosti sa postupne zvyšujú v hre Catching the Flag.