Mladý chlapec Thomas od detstva má rád šport ako gymnastika. Dosť často si naša postava zariaďuje malé tréningy priamo doma, aby sa udržala vo forme a zachovala si pružnosť tela. V dnešnom Flex Run sa k nemu pripojíte v jednom z týchto tréningov. Pred vami na obrazovke uvidíte svoju postavu, ktorá bude v jednej z miestností svojho domu. Vaša postava bude musieť bežať po určitej trase. Na jeho ceste sa objavia domáce potreby a nábytok. Dômyselným ovládaním svojej postavy mu budete musieť pomôcť vyhnúť sa kolíziám s týmito predmetmi. Každý úspešný úskok, ktorý urobíte vo Flex Run, bude ocenený určitým počtom bodov.