Slávneho žoldniera prezývaného Búrka si americká vláda najala na vykonávanie tajnej misie. Náš hrdina bude musieť preraziť cez rieku na nepriateľskú vojenskú základňu a zničiť tam niekoľko vysokých veliteľov. Vy v hre Commando Boat pomôžete hrdinovi pri vykonávaní tejto úlohy. Pred sebou na obrazovke uvidíte rieku, pozdĺž ktorej sa bude vaša postava rútiť na svojej lodi a postupne naberať na rýchlosti. Na ceste jeho pohybu vzniknú rôzne druhy prekážok. Pomocou ovládacích kláves prinútite čln robiť manévre po vode a vyhnúť sa tak kolíziám s týmito prekážkami. Rieku hliadkujú nepriateľské lode a člny. Ak sa k nim priblížite, budete musieť spustiť paľbu, aby ste zabili. Pri presnej streľbe zničíte nepriateľské lode a získate za ne body. Skúste tiež zbierať zlaté mince a ďalšie predmety plávajúce vo vode. Prinesú vám body a môžu vás oceniť rôznymi užitočnými bonusmi.