Draci, ako všetky lietajúce stvorenia, sa nenarodia so všetkými potrebnými schopnosťami lietať. Musia sa učiť a spravidla rodičia alebo niekto zo starších ide príkladom. Ale náš hrdinský drak v hre Flappy Dragon nemal šťastie. Stratili ho dlho pred narodením, vajíčko vypadlo z hniezda a narodilo sa dieťa, nevediac, kto je jeho mama a otec. Napriek tvrdým podmienkam sa mu podarilo prežiť a keďže hrdina bol veľmi schopný, pri pohľade na vtáky začal skúšať svoje krídla. Keď sa mu podarilo vstúpiť do vzduchu, drak sa rozhodol nájsť svojich rodičov a vy mu môžete pomôcť prekonať dlhú cestu, lietať okolo prekážok.