Statečný ninja Kyoto dostal úlohy z hlavy svojho poriadku a vy v hre Super Ninja Hero mu budete musieť pomôcť dokončiť ho. Váš hrdina sa bude musieť dostať do hradu jedného aristokrata cez žalár a odtiaľ ukradnúť dôležité dokumenty. Všetky dungeon bude priebežnou prekážkovou dráhou. Budete obratne ovládať svojho hrdinu, budete musieť prekonať všetky. Tiež, váš hrdina bude musieť bojovať s rôznymi monštrami a vojaci ochrany, ktorí sú v tomto bludisku. Na ceste budete musieť zbierať rôzne predmety a zbrane roztrúsené všade.