Puzzle s číslami Jelly Links vás vyzýva, aby ste vytvorili spojenie medzi gombíkmi želé na každej úrovni. Niektoré tlačidlá majú čísla, ostatné sú sivé s otáznikom. Ak chcete vybrať číslo podľa pravidiel hry, musíte kliknúť na sivé prvky. Uvádza, že v riadku alebo stĺpci by nemali byť dve rovnaké čísla. Zmeniť môžete len čísla na šedých tlačidlách, ostatné sú pevné a v Jelly Links sa nedajú zmeniť. Úrovne v hre budú postupne náročnejšie, zväčší sa plocha poľa a pribudne viac tlačidiel.