Po sérii katastrof spôsobených človekom sa ekológia planét výrazne zhoršila a pre ľudí je ťažké žiť. Objavili sa mutanti, ktorí sa rýchlo prispôsobili novým podmienkam. Ich krv by sa mohla stať základom pre vytvorenie vakcíny, ktorá pomôže obyčajným ľuďom stať sa silnejšími a zdravšími. Hrdina hry Mutant Blood je svetoznámy vedec, ktorý spojil všetky inteligentné hlavy planéty, aby vytvoril vakcínu. Vo všetkých tajných laboratóriách sa začalo pracovať, ale objavili sa tí, ktorí chcú zasahovať do procesu v Mutantblood – to sú extrémisti.
