Tvrdenie, že čím viac mozgov, tým je človek múdrejší, sa mýli, ale hrdina hry Braininess 2 tomu neverí a chce nazbierať čo najviac mozgov. Je si istý, že potom bude veľmi inteligentný. Netreba ho sklamať, stačí hrdinovi pomôcť splniť úlohu. Na každej úrovni musíte viesť postavu po bielych dlaždiciach, zbierať mozgy a zastaviť sa na poslednej žltej dlaždici. Predpokladom na dokončenie úrovne je pozbierať všetky mozgy. Pamätajte si, že keď raz stúpite na dlaždicu, zmizne, takže už niet návratu. Naplánujte si trasu, aby ste v Braininess 2 neurobili chyby.