Pri vyšetrovaní ďalšieho prípadu našiel hrdina hry Mystery Subway Escape 2, detektív Michael, tajný vchod do opustených staníc metra. Málokto o nich vie. Nehovoríme o technických tuneloch, ale o staniciach, ktoré boli kedysi v prevádzke, no z toho či onoho dôvodu sa ukázali ako uzavreté a nevyžiadané. Zostalo tam nejaké vybavenie, veci a predmety, ktoré sa nevyhodili, pretože by sa ešte mohli hodiť. Práve tam bude náš hrdina hľadať dôkazy a potom cestu von, pretože dvere, kam vstúpil, niekto zamkol v Mystery Subway Escape 2. Zrejme ho sledovali a rozhodli sa úzkostlivého detektíva zbaviť.
