Ninja sa dlho učil a konečne prišiel čas využiť svoje vedomosti a zručnosti v Dark Ninja Hanjo. Sensei informoval svojho študenta, že je pripravený začať samostatný život, ale zároveň bol bývalý študent požiadaný, aby vykonal veľmi dôležitú misiu obnoviť mesto. Misia ukáže, ako je hrdina pripravený. Mesto je pohltené temnotou, aby ste ho oslobodili, budete musieť bojovať s démonmi alebo posadnutými bojovníkmi. Ninja bude môcť ukázať, čoho je schopný. Prijmite pokyny od učiteľa v počiatočnej fáze, bude sprevádzať svojho študenta, ale potom musíte konať sami v Dark Ninja Hanjo.
