Tím odvážnych výskumníkov sa vydal na vesmírnu expedíciu s cieľom nájsť priateľské civilizácie v Bubble Throw. Počas letu do lode prenikla istá nepriateľská látka, ktorá je doplnená rôznofarebnými bublinami a hrozí, že loď zachytí zvnútra. Hrdinovia zistili, že proti invázii môžu bojovať rovnako farebnými loptičkami ich hádzaním a vytváraním skupín troch alebo viacerých rovnakých na následné zničenie. Na dokončenie úrovne v hre Bubble Throw musíte získať požadovaný počet bodov. V hre je celkovo päťdesiat úrovní a ich náročnosť sa neustále zvyšuje.
