Udalosti z minulosti sa často odrážajú v prítomnosti, a to preto, že udalosť nedostala svoj logický záver alebo si vyžaduje pomstu. Toto sa stalo v Samurai Rurouni Wars so samurajom v duchu, ale v podstate tulákom. Cestuje po svete a bojuje proti zlým chlapom. V minulosti bol jeho otec zradený tými, o ktorých si nikdy nemyslel, že je to možné, a to zmenilo samuraja na to, čím sa stal - ronina. Nechce slúžiť jednému pánovi, jeho údelom je osamelosť a večný boj so zlom. Pomôžete hrdinovi presunúť sa z domény do domény, aby ste odstránili zlú masku krutých samurajov, ktorí sa dostali na temnú stranu vo vojnách Samurai Rurouni.