Čaká vás cesta do sveta Kogama, vydáte sa tam za príšerami Skibidi, ktoré si ho vybrali zajať. Rozhodli sa, že tento svet je technologicky podradený ostatným a získa si ich celkom ľahko, no miestni majú na túto vec svoj názor. Sú pripravení bojovať v hre Kogama: Skibidi Toilet a vy sa tiež zúčastnite tejto konfrontácie. Na samom začiatku hry si budete musieť vybrať stranu, za ktorú budete bojovať, od toho bude závisieť vývoj udalostí v budúcnosti. Potom bude vaša postava na štartovacom mieste, kde si môžete vyzdvihnúť zbraň. Potom budete pokračovať v hľadaní nepriateľa, preto sa budete musieť presunúť z jedného miesta na druhé. Snažte sa pohybovať nepozorovane, pretože vaši nepriatelia vás budú tiež loviť. Hneď ako nájdete súpera, budete ho musieť napadnúť. Snažte sa čo najefektívnejšie využiť celý arzenál zbraní, ktoré máte k dispozícii. Budete musieť zničiť svojich protivníkov a za každého nepriateľa, ktorého v hre Kogama: Skibidi Toilet porazíte, získate body, ktoré vám umožnia zakúpiť si novú muníciu. Pokúste sa pozbierať lekárničky a muníciu, ktoré budú roztrúsené po lokalitách.
