Chlapík menom Tom zdedil malú továreň, ktorá upadala. Náš hrdina sa rozhodol začať ho vyvíjať. V hre Mega Factory mu s tým pomôžete. Na obrazovke pred vami bude viditeľná vaša postava, ktorá sa bude nachádzať v jednom z priestorov továrne. Prvá vec, ktorú budete musieť urobiť, je prejsť si to a všetko si pozorne pozrieť. Budete musieť zbierať zlaté mince, ktoré sú roztrúsené na podlahe miestnosti. Potom uvediete továrenské zariadenie do prevádzky. Začne vyrábať produkty, ktoré budete musieť zabaliť. Produkt následne naložíte na kamión, ktorý ho dovezie zákazníkom. Za to dostanete peniaze. Môžete ich minúť na nákup nového vybavenia pre továreň, suroviny na prácu a najímanie zamestnancov. Takže postupne v hre Mega Factory budete organizovať prácu továrne.