Beh po herných dráhach už dávno nie je tradičný, niekedy sa beží v opätkoch, niekedy s tyčou, inokedy so schodmi a hra Balance Run 3D zašla ešte ďalej. Náš hrdina sa bude pohybovať po doske, ktorá sa nachádza na dvoch stĺpikoch blokov. Na prekonanie všetkých prekážok musíte po ceste zbierať žlté bloky, no treba dodržiavať rovnováhu. Ak je ľavý alebo pravý stĺpik oveľa nižšie, doska sa príliš nakloní a hrdina jednoducho skĺzne a hra Balance Run 3D skončí. Úrovne sú postupne ťažšie, ale isto.
