Okrem denných zmien po meste má Spider-Man tajné misie na kontrolu mieru obyvateľov mesta. Členovia vlády a rôznych orgánov. Krajiny súvisiace s bezpečnosťou. Obracajú sa na super hrdinu o pomoc v obzvlášť ťažkých a dôležitých záležitostiach, kde si bežní ľudia nevedia rady. V hre Spider-man vs Robot nájdete hrdinu, ktorý práve plní takú špeciálnu misiu. Musí sa infiltrovať na tajnú základňu, kde sa usadili a zničili teroristi v globálnom meradle. Prístupy k základni sú ale starostlivo strážené a hrdina bude musieť v Spider-man vs Robot čeliť celej horde robotov a zombie.
