V druhej časti hry Virus Ninja 2 pomôžeme odvážnemu bojovníkovi ninja bojovať proti rôznym vírusom. Pred vami na obrazovke bude hracie pole, na ktorom sa objavia rôzne baktérie. Pohybujú sa rôznymi smermi a rôznymi rýchlosťami. Na ich zničenie budete musieť použiť meč. Opatrne sa pozerajte na obrazovku a pomocou myši posúvajte predmety. Takto narazíte na baktérie a nasekáte ich na kúsky. Medzi týmito predmetmi sa niekedy môžu objaviť bomby. Nemali by ste ich hojdať.
