V blízkosti veľkej metropoly v Amerike pristáli lode cudzincov a napadli mesto. Teraz sú všetky ulice spojitou zónou vojenských operácií. Budeme sa v hre Attack of Alien Mutants ako vojak Národnej gardy zúčastniť tohto konfliktu. Vašou úlohou je odstrániť útočníkov z centra mesta a pomôcť zachrániť ľudí. Váš hrdina prejde mestskými ulicami a pomocou svojich zbraní zničí všetky príšery. Pokúste sa to urobiť na diaľku a nenechajte sa ublížiť monštrami. Koniec koncov, ak sa to stane, váš hrdina môže zomrieť. Taktiež zbierajte rôzne položky, ktoré vám pomôžu vo vašom boji.