Nindroidov obrovská armáda vzbúrili a začali dobývať planétu. Statoční hrdinovia hry "Go Ninja: Rise Nindroidov" snaží zastaviť povstanie, a za to, že je potrebné sa dostať do nepriateľskej základne a zničiť vodcu. Pred dlhou cestou, môžete hrať za každý ninja, ktorý je v hre. Rôzne situácie vyžadujú rôzne charaktery. Zmena postavy ožívajú v hre v špeciálnom portálu. Ak chcete prelomiť bariéru, vyvolať silný ninja so sekerou, nakrájame ju na kúsky všetkých. Zbierajte po ceste lekárničke, ale skôr sa snaží udržať sa nepriateľov.
