Hra Alien Quarantine sa odohráva na území tajného laboratória, kde sa vykonávajú experimenty na zajatých mimozemských tvoroch. Jednému z mimozemšťanov sa podarilo vyslobodiť, oslobodil ostatných a v laboratóriu sa začal skutočný chaos. Hrdina hry Alien Quarantine je poslaný na prieskum, ale čelí nebezpečnému nepriateľovi. Potrebuje obnoviť bezpečnostný systém, aby zabránil monštrám preniknúť do iných sektorov. Aby ste to dosiahli, musíte aktivovať niekoľko zariadení, pohybovať sa a strieľať, vyhýbať sa útokom mimozemšťanov.
