V tajnom výskumnom komplexe, v jednom zo sektorov číslo deväť, došlo k nehode. Došlo k prerušeniu dodávky energie, a preto môže dôjsť k prerušeniu experimentu, ktorý už nejaký čas trvá, čo povedie k nezvratným následkom. Hrdina hry Sector Nine: Lockdown išiel napraviť situáciu. Je potrebné obnoviť dodávku energie, ale dostať sa k zdroju nie je jednoduché; cesta je nečakane zablokovaná strašidelnými bytosťami. V Sector Nine: Lockdown si budete musieť vyčistiť cestu pohybom, streľbou a skákaním po plošinách
