Klasická bublinová strieľačka v hre Bubble Invasion 3D sa prenesie do trojrozmerného priestoru a bubliny sa zmenia na viacfarebné gule. Zákerne postupujú zhora a vašou úlohou je zraziť loptičky tým, že do nich budete strieľať rovnaké loptičky. Aby ste dosiahli zostrel, musíte loptičku spustiť tam, kde môžete vytvoriť skupinu troch alebo viacerých loptičiek rovnakej farby. Celá skupina padne dole a na vrchole bude menej loptičiek. Ak chcete prejsť úrovňou, musíte v hre Bubble Invasion 3D zostreliť určitý počet loptičiek určitej farby.
