Vodný svet je často nebezpečný a nepredvídateľný; medzi jeho obyvateľmi vždy prebieha boj o prežitie a v hre Fish Runner pomôžete niektorým z morských živočíchov prežiť a dokonca aj poraziť konkurentov. Vašou prvou postavou je roztomilý delfín, ktorého treba viesť kanálom, zbierať kryštály a peniaze, ako aj obchádzať alebo ničiť prekážky. Venujte zvláštnu pozornosť kryštálom, sú to tie, ktoré vyplnia životnú škálu vašich rýb. Je to dôležité, pretože v cieli vás čaká súboj s nepriateľom a ak vám vitalita nebude stačiť, vo Fish Runner nepriateľa neporazíte.
