Mystické znaky vyplnia podmienky na mysty. Vašou úlohou nie je očistiť pole, ale naopak- zvýšiť počet magických guľôčok. Aby ste to dosiahli, musíte zlúčiť rovnaké prvky. Potrebné sú najmenej tri prvky, ktoré sa musia navzájom kombinovať postupne. Môžete usporiadať okrúhle objekty, aby ste dostali to, čo chcete. Ak už neexistujú ďalšie pohyby, hra Mystic Signs sa skončí. Po zlúčení sa na ihrisku objavia ďalšie mystické znaky, a preto budete vykonať nové fúzie.