Vedci na celom svete, každý vo svojom odbore, neúnavne pracujú na nejakom veľkom objave. Len máloktorým sa to však podarí, väčšina štúdií zostáva nedokončená. Ich financovanie je uzavreté z dôvodu nedostatku vyhliadok alebo neúspechov v experimentoch. Hrdinkami hry Library Mysteries sú študenti jednej zo slávnych univerzít. Amelia, Candice a Ava sú zanietené pre vedu a chcú sa stať slávnymi. Dozvedeli sa, že jeden z profesorov na ich inštitúcii sa zaoberal serióznym vedeckým vývojom, ale projekt bol uzavretý a profesor zmizol. Dievčatá by chceli nájsť jeho diela v univerzitnej knižnici a študovať ich. Pomôžte dievčatám v Library Mysteries.