Akýkoľvek druh činnosti si vyžaduje profesionalitu, no v niektorých profesiách je potrebné dodržiavať aj určité morálne aspekty, a to sa týka najmä rôznych vedeckých výdobytkov, ktoré môžu ľuďom uškodiť. Hrdina hry Secret Lab Chronicles, profesor Benjamin, dostal lákavú ponuku pracovať v súkromnom laboratóriu na niektorých tajných experimentoch. Rozhodol sa súhlasiť, ale keď začal pracovať, uvedomil si, že ak budú experimenty úspešné, ľudstvo bude čeliť ďalšej hrozbe objavenia sa zbrane, ktorá sa nedá porovnať so žiadnou z existujúcich. Hrdina chce odhaliť všetkých, ktorí stoja za vytvorením a prevádzkou laboratória, no potrebuje dôkazy a vy ich musíte zozbierať v Secret Lab Chronicles.
