Človek svojou nerozumnou činnosťou vytvoril vo svete vírusov nerovnováhu. Ak skôr mohli koexistovať s ľuďmi, potom odkedy sa s nimi naučila bojovať, vírusy začali mutovať a meniť sa. Stáva sa silnejším a tento proces sa nezastaví. S týmto prístupom môžete získať vírus, ktorý žiadna vakcína nedokáže prijať. Existuje však aj iné východisko - viesť zdravý životný štýl, posilniť imunitný systém, aby si dobré vírusy poradili so zlými. V hre Run Healthy 2 pomôžete hrdinke prejsť levelmi a stať sa zdravšou. Aby ste to urobili, zbierajte jablká, činky, prejdite zelenou bránou a v cieli musíte vziať obrovské kladivo a trafiť Run Healthy 2.