Ovocie v Fruit Ninja nie je určené na jedenie ako šalát alebo len tak pre zábavu. Hrdina hry ninja nazbieral veľa ovocia, aby nestratil svoje zručnosti s mečom katana. Hrdina pracuje ako kuchár v kaviarni, pred pár rokmi opustil rodnú krajinu nie z vlastnej vôle, ale skrýval sa pred miestnou mafiou. Ale ruky mafie sú dlhé a môžu ho kedykoľvek nájsť, čo znamená, že musíte byť pripravení a vyžaduje sa tréning. A keďže po ruke nie je žiadne špeciálne športové vybavenie, budete musieť použiť ovocie. Asistent vám bude hádzať melóny, banány, jablká, kivi a iné ovocie a vy ich nakrájate v Fruit Ninja.
