V hre Ben 10: Brains vs Bugs budete musieť pomôcť zábavnému zelenému mimozemšťanovi oslobodiť jeho unesených priateľov. Pred vami bude na obrazovke viditeľná vaša postava, ktorá sa bude nachádzať na určitom mieste. Pomocou ovládacích kláves budete riadiť jeho akcie. Váš hrdina bude musieť kráčať po určitej trase, prekonávať rôzne pasce a iné nebezpečenstvá. Na ceste bude zbierať zlaté mince a ďalšie užitočné predmety, ktoré vám prinesú body v hre Ben 10: Brains vs Bugs a môžu dať postave rôzne druhy bonusov. Aj vaša postava bude musieť bojovať s chrobákmi, ktoré sa na jej ceste stretnú.
