Napriek tomu, že ryby neustále plávajú vo vode, potrebujú kyslík a ten využívajú vo forme rozpusteného vo vode. Sú ale situácie, kedy potrebný objem nestačí a vtedy ryba vystúpi na hladinu a nadýchne sa vzduchu. V hre Bubble Fish sa nešťastné ryby ocitli v kritickej situácii nedostatku kyslíka a keď uvideli bubliny naplnené vzduchom, vrhli sa priamo k nim a zmenili sa na zajatcov. Vašou úlohou je oslobodiť ryby v Bubble Fish a na to použijete magický trojzubec Neptúna. Vyberte si rybu a premiestnite ju na miesto, kde sú v blízkosti tri alebo viac rýb rovnakej farby, aby bubliny praskli.