Chlapec menom Jack je v meste známym násilníkom, ktorý neustále maľuje steny mestských budov. Raz vošiel na stanicu a začal tam kresliť ďalší obrázok. Z tohto dôvodu ho chytil policajt a teraz bude musieť náš človek pred ním utiecť. V Rail Runner pomôžete Jackovi v tomto dobrodružstve. Pred sebou na obrazovke uvidíte svoju postavu, ktorá pobeží po železničných tratiach postupne naberajúcich rýchlosť. Na jeho ceste sa vyskytnú rôzne prekážky. Keď je váš hrdina blízko jednej z prekážok, budete musieť použiť určité ovládacie klávesy. Potom váš hrdina skočí a preletí túto prekážku. Ak nemáte čas zareagovať, na úteku do nej vrazí a zraní sa.
