Pozrite sa do Hubárskeho kráľovstva, opäť nastala mimoriadna situácia - Princezná Peach bola unesená. Ale tentoraz zlý Bowser s tým nemá nič spoločné, pretože to nie je prekvapujúce. Zlá vec odtiahla zlý duch a odletel s rukojemníkom na temnú stránku úplne iného sveta, ktorý nepatril tomu, v ktorom žije Mario. Odvážny inštalatér bude musieť prejsť do sveta Minecraftu a nájsť únosca. Keď sa raz stane na cudzom území, stane sa z neho Mario ako blokovaný obyvateľ, a to nie je prekvapujúce, že nemusí vystupovať. Pomôžte hrdinovi v Super Mario MineCraft Runner ponáhľať sa po dlhej ceste s prekážkami pri zbieraní mincí.