V modernom svete je dosť smrteľných vírusov, ktoré spôsobujú smrť rôznym živým tvorom. Dnes v Kill The Microbes budete musieť bojovať proti niektorým z ich druhov. Predtým, ako na obrazovke uvidíte niekoľko mikroorganizmov umiestnených na rôznych miestach na ihrisku. Musíte si vybrať jeden z nich a kliknúť naň myšou. Týmto spôsobom si podáte liek a spôsobíte, že baktéria vybuchne. Jej kúsky, ktoré spadajú do iných mikroorganizmov, ich zničia a za to získate body.
