Jeden z aristokratov najal skupinu ninja na zabitie japonského cisára. Nachádzate sa v Beat Ninja Blam! budete ho musieť chrániť. Aby prenikli do paláca, ninja bojovníci urobili kopu. Budete prepadnutí a budete čakať na ich vzhľad. Pred vami uvidíte na obrazovke otvory, z ktorých sa objaví ninja. Budete rýchlo reagovať, budete musieť kliknúť na ne pomocou myši. Takto ich zaútočíte a zničíte ich. Za každého porazeného nepriateľa dostanete určitý počet bodov.