Krtkove kráľovstvo pokojne existovalo na okraji lesa a nikomu neprekážalo, no v jednom momente Krtkovho kráľovstva sa musel zmeniť na ochrancu celého lesa, keďže kráľovstvo leží na hranici. Pokojný život sa skončil, keď les napadli príšery: lietanie, plazenie a beh. Krtkový pohraničník dostal prvý úder, no čoskoro mu privediete na pomoc mága, lukostrelca a kopijníka. Budú brániť svoje hranice a nedovolia nepriateľovi prejsť. Výber vylepšení počas bitky závisí od vás. Na konci každej vlny útokov sa objaví boss, ktorého nie je ľahké v Mole Kingdom Defense zničiť.
