Na jednej z lesných paliem nachádzajúcich sa v kúzelnom lese sa objavili farebné bubliny naplnené jedovatým plynom. Postupne zostupujú. Vy v hre Bubble Invasion ich budete musieť všetky zničiť a nedovoliť, aby sa bubliny dotkli zeme. K tomu budete musieť použiť špeciálne delo, ktoré bude strieľať delové gule určitej farby. Keď sa objaví jadro, budete musieť veľmi opatrne preskúmať zhluk bublín a nájsť presne tie isté farebné objekty ako váš náboj. Potom nasmerujete náhubok na tieto objekty a vystrelíte výstrel. Jadro, ktoré zasiahne potrebné predmety, ich zničí a za to vám budú pridelené body. Takto tieto objekty zničíte a získate za ne body.
