Obyvatelia Bikini Botom v úplnom zúfalstve, ich obľúbená kaviareň, miesto zhromažďovania a zdroj lahodných krabovcov zmizli. Zlý Plankton nakoniec splnil svoju dlhotrvajúcu hrozbu a prevzal reštauráciu. Zhromaždil obrovský robot a presunul celú budovu na tajné miesto. Sponge Bob sa nebude ustúpiť, všetci obyvatelia lagúny počítajú s hrdinom a dúfa, že vás v hre Spongebob Run. Pomôžte charakteru ponáhľať sa k darebému doupru, kamaráti mu pomôžu zmeniť vzhľad, aby bolo ľahšie sa vyrovnať s početnými malými robotmi, ktorí sa zmietajú a pokúšajú sa zabrániť. Zbierajte guľaté škrupiny a prejdite na úroveň.